Во время расследования одного случай, Сильвестр случайно запускает таймер на взрывном устройстве, однако жизнь их друга находится под угрозой, команда должна найти виновников данного происшествия.
Команда должна не допустить рассекречивания технологии стелс, после крушения в Боснии военного самолета. Между тем сестра Уолтера решила прервать свое лечение и проводить время в гараже вместе с Сильвестром.
Команда сосредоточена на помощи жене Кэйба, которой удалось найти неопровержимые доказательства, раскрывающие нечестную игру, приведшую к гибели одного из конгрессменов.
С помощью талантливого музыканта, который придумал уникальный алгоритм, команде удается выйти на след убийцы музыкального блоггера. Тем временем Уолкер соглашается помочь Дрю вновь встретится с сыном.
Данный случай особо интересен для команды Скорпиона, когда в деле замешан такой же умный хакер, занимающийся кражей огромных сумм через интернет. Ральф с нетерпением ожидает приезда своего отца.
Чтобы дальше продолжить свою работу команда вынуждена пройти некоторый тест, после того, как по их вине были уничтожены ценные произведения искусства. Также они помогают Пейдж убедить сына пойти на Хэллоуин.
Один из ядерных реакторов Лос-Анджелеса выходит из строя, что может повлечь за собой серьезную катастрофу, команде необходимо наладить его работу, при этом заручившись поддержкой старого друга.
Лидер команды Скорпион попадает за решетку во время выполнения несложного задания в Лас-Вегасе, когда в этот момент произошло крупнее ограбление. Остальным участникам необходимо помочь своему другу.
Команда Скорпиона вынуждена реабилитироваться перед Кэйбом, когда завалили программа по военному обучению, ради этого им необходимо решить задачу с террористом пригрозившим уничтожить интернет инфраструктуру.
Загадочным способом дочка губернатора заражается смертельным вирусом, поэтому он обращается к команде, чтобы те успели управится за 24 часа. Уолтер имеет особый интерес к данному случаю из-за письма сестры.